Phần mềm diệt virus và chống mã độc là hai loại phần mềm bảo vệ khác nhau. Hiện nay, nhiều phần mềm diệt virus đã tích hợp công nghệ chống mã độc. Phần mềm diệt virus tập trung vào việc phát hiện virus đã biết, trong khi phần mềm chống mã độc tập trung vào việc phát hiện và loại bỏ mã độc mới và tinh vi. Người dùng có rủi ro cao hoặc muốn lớp bảo vệ thứ hai có thể chọn phần mềm chống mã độc, nhưng phần mềm diệt virus uy tín tích hợp chống mã độc là lựa chọn tốt nhất cho đa số người dùng.
